Entre 1866 et 1882, la population de la Nouvelle Californie (qui deviendra Malakoff en 1883), a presque triplé ! Elle dépasse désormais celle de la commune de Vanves.

L'église est quasiment le seul équipement à disposition des habitants.

Édifiée en 1861 grâce à des subventions de la Préfecture de la Seine et quelques dons privés, elle est construite comme simple chapelle du "Petit Vanves" sur un terrain offert par des lotisseurs, Mrs Turgie et Danicourt.

En 1872, la chapelle est transformée en paroisse indépendante, dotée de son propre curé et baptisée église Notre-Dame de la Médaille.

En 2010, un important chantier de rénovation permet de réhabiliter l'intérieur du bâtiment. À cette occasion, l'église est renommée Notre-Dame de Malakoff. La Municipalité a par ailleurs pris en charge la restauration du tableau attribué au célèbre peintre Philippe de Champaigne, La fuite en Egypte, classé au titre des objets en 1907.